MENU
|
|
|
| Jenis | : |
KKM
|
| Judul | : |
Analisis keragaman genetik apel (Malus spp Mill) berdasarkan penanda simple sequence repeat
|
| Subjek | : |
Apel : Malus spp M, keragaman genetik, penanda SSR
|
| Pengarang | : |
YANUAR, Muhamad Farkhan
|
| Pembimbing | : |
1. Imastini Dinuriah
2. Devit Purwoko
|
| Prodi | : |
AGROTEKNOLOGI
|
| Tahun | : |
2019
|
| Call Number | : |
634.11 YAN a
|
| Perpustakaan | : |
Fakultas Pertanian
|
| Letak | : |
1 eksemplar di Skripsi
|
|
Abstrak :
Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui keragaman genetik 39 aksesi tanaman apel berdasarkan analisis molekuler berbasis SSR. Pelaksanaan penelitian dilakukan di Laboratorium Teknologi Genom, Balai Bioteknologi, Badan Pengkajian dan Penerapan Teknologi, Tangerang Selatan mulai bulan Februari 2019 sampai April 2019. Penelitian ini terdiri dari lima bagian utama, yakni karakterisasi morfologi, isolasi DNA, uji kualitas dan kuantitas DNA, amplifikasi PCR, dan analisis data. Hasil penelitian menunjukkan bahwa terdapat keragaman pada karakter morfologi, dan analisis kluster menggunakan perangkat lunak TASSEL menunjukkan adanya 12 kelompok berdasarkan karakter panjang dan lebar daun. Uji kemurnian DNA menggunakan elektroforesis gel agarosa 1,5 % yang memperlihatkan tingkat kemurnian DNA yang memenuhi syarat untuk proses PCR. Visualisasi hasil PCR dengan primer SSR menghasilkan pola pita polimorfis. Dendogram 39 aksesi tanaman apel berdasarkan analisis DARwin versi 6 menunjukkan terbentuknya 3 grup besar yang mengelompok. Kekerabatan paling dekat terdapat pada aksesi MN3 dan MIMN5. Analisis polimorfisme dengan perangkat lunak PowerMarker versi 3.25 menunjukkan bahwa sebanyak 83 alel terdeteksi dengan rata-rata 10,38 alel per penanda. Sebanyak 5 penanda (5 PA, 6 PA, 12 PA, 13 PA, 14 PA) dari 8 penanda yang dievaluasi memiliki nilai PIC>0,5, sehingga penanda ini sangat tepat digunakan untuk menguji keragaman genetik apel.
Kata Kunci: Malus spp M., keragaman genetik, penanda SSR, DARwin, PowerMarker, dan TASSEL
|
Kembali
|
